该故事的舞台设定在系列作品的原点——先代《苍天之青玉》活跃的年代。经过艰辛的最终决战得以生还的人类，封印以前众多的高科技技术，并将世界的命运委托给身为主人的王侯贵族及其命脉相连，拥有超常能力的少女“乙HiME”。数度的战乱虽…